目前，我国原料药产业在国际市场的主导地位已经越来越弱。而由此带来的需求下降，成本上升以及来自印度等新兴市场的挑战，更使我国原料药面临着市场需求和生产成本的双重压力。
同时，因原料药行业的部分领域进入门槛比较低，一些企业便在利润的驱使下，采取扩大产能、压缩成本的模式，这就导致了产供严重失衡，使企业失去价格的话语权。当然，原辅料、水电煤运等成本居高不下，也致使医药生产成本不断提高。特别是近几年，原料药企的人工费用持续上涨尤为明显。还有GMP改造给企业带来的成本压力也不容小视。
从国内来看，自主创新能力依然较弱，多数产品靠低成本进行国际竞争。据统计，我国制药工业97%均为仿制药，制药企业不是在某一点上发展自己的独特优势，而是什么赚钱干什么。结果造成行业内互相厮杀，落得两败俱伤。
从国际来看，仅以我们的近邻印度为例，情形已发生明显变化：印度药企在技术水平上已逐渐与我国企业拉开档次，抢占了国际市场先机。同时，印度还利用我国内外销产品的价格差，低价从我国进口优质原料药，再加工成下游产品与中国产品竞争。
