《规划》明确了“十二五”期间发展目标，到2015年，现代农业建设取得明显进展。粮食等主要农产品供给得到有效保障，农业结构更加合理，物质装备水平明显提高，科技支撑能力显著增强，生产经营方式不断优化，东部沿海、大城市郊区和大型垦区等条件较好区域率先基本实现农业现代化。到2020年，现代农业建设取得突破性进展，基本形成技术装备先进、组织方式优化、产业体系完善、供给保障有力、综合效益明显的新格局，主要农产品优势区基本实现农业现代化。
《规划》提出，从加快转变农业发展方式的关键环节入手，重点加强现代农业产业体系、农业科技、农业基础设施和装备条件等八大方面建设。
尤其需要注意的是，《规划》再次明确了“大力发展现代农作物种业”，提出要整合种业资源，培育一批具有重大应用前景和自主知识产权的突破性优良品种，建设一批标准化、规模化、集约化、机械化的良种繁育和生产基地，打造一批育种能力强、生产加工技术先进、市场营销网络健全、技术服务到位的现代种业集团。
此外，《规划》提出，要构建以产业为主导、企业为主体、基地为依托、产学研相结合、育繁推一体化的现代种业体系，提升种业科技创新能力、企业竞争能力、供种保障能力和市场监管能力。实施好转基因生物新品种培育重大专项，加快发展生物育种战略性新兴产业。
《规划》列出未来五年要重点开展的14项重大工程，其中就包括现代种业工程。建设国家级农作物育制种基地，完善农作物品种试验和种子检测设施条件。
在保障措施方面，《规划》提出，建立农业投入稳定增长机制，加大农业支持保护力度。尤其是在农业科研和技术推广方面，要完善现代农业产业技术体系，继续实施转基因生物新品种培育重大专项、公益性行业科研专项等农业重大科研项目；建立种业发展基金。
此外，《规划》还明确提出，要按照扶优、扶大、扶强的原则，选择一批经营水平好、经济效益高、辐射带动能力强的农业产业化龙头企业予以重点扶持。依托农产品加工、物流等各类农业园区，选建一批农业产业化示范基地，推进龙头企业集群发展。引导龙头企业采取兼并、重组、参股、收购等方式，组建大型企业集团，支持龙头企业跨区域经营，提升产品研发、精深加工技术水平和装备能力。鼓励龙头企业采取参股、合作等方式，与农户建立紧密型利益联结关系。
