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色谱是一种分离分析手段，分离是核心，因此担负分离作用的色谱柱是色谱系统的心脏。对色谱柱的要求是柱效高、选择性好，分析速度快等。
安装
1.首先确认柱和仪器的接头以及管路是否匹配。为了减少死体积，进样阀、柱子、检测器之间的连接管路内径尽可能使用内径较小的管线，同时控制进样器、色谱柱和检测器之间连接管线的长度。
2.为了使色谱柱与仪器系统达最佳的连接效果，应尽量使用与色谱柱接口相匹配的螺帽和锥形接头。
3.使用PEEK 材料的通用接头，只需用手拧紧不需要特定扳手，使用压力为5000psi;使用温度不得超过100℃。
流动相
1.流动相使用前需用微孔滤膜过滤,消除流动相中颗粒对色谱系统和色谱柱的损坏。
2.在进行样品检测前，至少使用20倍柱体积流动相使色谱柱充分平衡。流动相一定要使用色谱级别的溶剂。
3.流动相需脱气后使用，可避免因气泡导致的泵和检测器的工作不正常。正相色谱柱比反相色谱柱需要更长的平衡时间。
样品制备
1.色谱柱由高压匀浆法装填，能承受较高压力。
2.样品应当尽可能溶解在能与流动相相互溶的溶剂中。
3.样品溶液在进样前应使用针对式过滤器对样品预先过滤，频繁改变流动相组成，会加速降低柱效。
保存方式
1.如果流动相含有酸或无机盐，应当先用去离子水(20倍柱体积)冲洗干净。然后用用100%乙腈或甲醇保存色谱柱。最后用柱子的接头密封，并放在稳定的环境中存放。
2.应避免色谱柱受到直接的机械冲击或摔落，避免造成色谱柱性能的降低。
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